На исследуемый участок кожи наносится специальный гель, который способствует увеличению прозрачности кожных покровов и предотвращению появления бликов. Затем на проблемный участок кожи направляется источник света. Исследуемое новообразование накрывается предметным стеклом, но его можно не использовать, если обследуется объемное или болезненное образование. После наведения дерматоскопа на родинку выполняется съемка ее поверхности. Затем при помощи специальной шкалы дерматолог определяет размер новообразования. Снимок, который получает врач, является многократным увеличением родинки. Если дерматоскоп подключен к компьютерной системе, специальная программа автоматически определяет степень опасности родинок или пигментных пятен. Если у пациента выявлены представляющие опасность новообразования, составляется специальная карта, полученные результаты дерматоскопии также сохраняются — для возможности наблюдения и сравнения в дальнейшем. Когда пациент приходит на следующий прием, специальная программа накладывает новое изображение на предыдущий снимок, у врача есть возможность проанализировать полученные результаты.